Der Cellist wurde 1983 in Bad Schwalbach geboren. Seinen ersten Cellounterricht erhielt er im Alter von vier Jahren an der Musikschule Aalen. Von 2004 bis 2009 studierte er das Fach Violoncello an der Staatlichen Hochschule für Musik und Darstellende Kunst Stuttgart als Künstlerische Ausbildung bei Helene Godefroy. Weitere Impulse erhielt er durch Meisterkurse und Studien u.a. bei Anner Bylsma, Conradin Brotbek, Christian Sikorski, Christine Busch, dem Mandelring sowie dem Vogler Quartett.

Bisher durfte Heiko Nonaka in vielen Orchestern wie dem Stuttgarter Kammerorchester, dem Württembergischen Kammerorchester Heilbronn, dem Radio-Sinfonieorchester des SWR und anderen gastieren. Neben der klassischen Musik gehören auch Filmmusik, Popularmusik und Jazz zum Repertoire des Künstlers. Konzerte mit dem Sirius String Quartet New York um Gregor Hübner sowie zahlreiche Aufnahmen für Firmen wie Klangerfinder, Score Concept, Delta Artworks u.a. belegen seine Offenheit gegenüber anderen Musikstilen und Improvisation. Konzertreisen als Solist, Kammermusiker oder im Orchester runden sein musikalisches Wirken ab. 

Seit 2014 ist Heiko Nonaka bei der Badischen Philharmonie Pforzheim angestellt.